Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms