Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms