Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms