Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A3Q5K4L6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms