Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms