Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LACTB2Q53H82 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms