Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP55Q53EZ4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms