Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms