Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRNQ4KMQ1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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