Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RTL8BQ17RB0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RTL8BQ17RB0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RTL8BQ17RB0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RTL8BQ17RB0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RTL8BQ17RB0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RTL8BQ17RB0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RTL8BQ17RB0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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