Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms