Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPP1R3AQ16821 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPP1R3AQ16821 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms