Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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NRF1Q16656 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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NRF1Q16656 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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NRF1Q16656 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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NRF1Q16656 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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NRF1Q16656 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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NRF1Q16656 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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NRF1Q16656 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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NRF1Q16656 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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NRF1Q16656 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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NRF1Q16656 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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NRF1Q16656 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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