Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
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