Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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CNGA3Q16281 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
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