Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USF2Q15853 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USF2Q15853 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USF2Q15853 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USF2Q15853 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USF2Q15853 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USF2Q15853 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USF2Q15853 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USF2Q15853 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USF2Q15853 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USF2Q15853 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USF2Q15853 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USF2Q15853 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USF2Q15853 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USF2Q15853 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USF2Q15853 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USF2Q15853 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USF2Q15853 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USF2Q15853 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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