Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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