Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1CQ15572 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
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