Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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SYCP1Q15431 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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SYCP1Q15431 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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SYCP1Q15431 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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SYCP1Q15431 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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SYCP1Q15431 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
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