Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NCF4Q15080 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms