Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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