Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms