Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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FAM53BQ14153 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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