Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL4A6Q14031 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms