Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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