Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms