Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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