Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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