Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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ITGB3BPQ13352 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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ITGB3BPQ13352 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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ITGB3BPQ13352 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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ITGB3BPQ13352 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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ITGB3BPQ13352 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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ITGB3BPQ13352 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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ITGB3BPQ13352 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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ITGB3BPQ13352 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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ITGB3BPQ13352 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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ITGB3BPQ13352 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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