Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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