Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms