Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NME3Q13232 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NME3Q13232 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NME3Q13232 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NME3Q13232 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NME3Q13232 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NME3Q13232 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NME3Q13232 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NME3Q13232 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NME3Q13232 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NME3Q13232 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NME3Q13232 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NME3Q13232 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NME3Q13232 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME3Q13232 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME3Q13232 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME3Q13232 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME3Q13232 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME3Q13232 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME3Q13232 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME3Q13232 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME3Q13232 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME3Q13232 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME3Q13232 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NME3Q13232 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME3Q13232 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME3Q13232 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NME3Q13232 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME3Q13232 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME3Q13232 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME3Q13232 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME3Q13232 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME3Q13232 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME3Q13232 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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