Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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ERCC8Q13216 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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ERCC8Q13216 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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ERCC8Q13216 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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ERCC8Q13216 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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ERCC8Q13216 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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ERCC8Q13216 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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