Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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SEMA3BQ13214 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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