Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSPB3Q12988 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
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