Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms