Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC8Q09428 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms