Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms