Protein–RNA interactions for Protein: Q08426

EHHADH, Peroxisomal bifunctional enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHHADHQ08426 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
EHHADHQ08426 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms