Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms