Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK18Q07002 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK18Q07002 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK18Q07002 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK18Q07002 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK18Q07002 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms