Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FMODQ06828 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms