Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms