Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms