Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms