Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms