Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms