Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms