Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms