Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms